Nebenwirkungen treten bei Antidepressiva hauptsächlich im vegetativen Nervensystem auf. Appetitverlust, Übelkeit, Kopfschmerzen, Schwindel, Mundtrockenheit und Herzklopfen können aber müssen nicht vorkommen und treten vor allem in der Anfangsphase auf. Im Laufe der Therapie bilden sich diese vegetativen Störungen häufig zurück. Neuere Antidepressiva, wie zum Beispiel
Selektive Serotonin-Wiederaufnahmehemmer (SSRI) werden von vielen Menschen gut vertragen. Die vorkommenden Nebenwirkungen können von Patient zu Patient sehr unterschiedlich und sogar entgegengesetzt sein (zum Beispiel kann dasselbe Antidepressivum bei einem Patienten zu Müdigkeit und bei einem anderen zu Schlaflosigkeit führen).